| Gençlerbirliği | | 3 | - | 1 | | Antalyaspor | 20 Ağustos 2012 Pazartesi 19:30 | 1. Hafta | |
| Akhisar Bld. | | 0 | - | 0 | | Gençlerbirliği | 25 Ağustos 2012 Cumartesi 21:45 | 2. Hafta | |
| Gençlerbirliği | | 1 | - | 1 | | Orduspor | 31 Ağustos 2012 Cuma 19:00 | 3. Hafta | |
| Eskişehirspor | | 4 | - | 2 | | Gençlerbirliği | 16 Eylül 2012 Pazar 18:00 | 4. Hafta | |
| Mersin İ. Yurdu | | 1 | - | 1 | | Gençlerbirliği | 22 Eylül 2012 Cumartesi 20:00 | 5. Hafta | |
| Gençlerbirliği | | 4 | - | 0 | | Kayserispor | 30 Eylül 2012 Pazar 20:00 | 6. Hafta | |
| İstanbul BBSK | | 0 | - | 2 | | Gençlerbirliği | 6 Ekim 2012 Cumartesi 16:00 | 7. Hafta | |
| Gençlerbirliği | | 3 | - | 3 | | Galatasaray | 19 Ekim 2012 Cuma 20:00 | 8. Hafta | |
| Karabükspor | | 0 | - | 0 | | Gençlerbirliği | 28 Ekim 2012 Pazar 16:00 | 9. Hafta | |
| Gençlerbirliği | | 1 | - | 2 | | Elazığspor | 4 Kasım 2012 Pazar 16:00 | 10. Hafta | |
| Gaziantepspor | | 2 | - | 3 | | Gençlerbirliği | 11 Kasım 2012 Pazar 14:00 | 11. Hafta | |
| Gençlerbirliği | | 1 | - | 1 | | Sivasspor | 17 Kasım 2012 Cumartesi 19:00 | 12. Hafta | |
| Fenerbahçe | | 4 | - | 1 | | Gençlerbirliği | 25 Kasım 2012 Pazar 19:00 | 13. Hafta | |
| Gençlerbirliği | | 0 | - | 4 | | Trabzonspor | 3 Aralık 2012 Pazartesi 20:00 | 14. Hafta | |
| Kasımpaşa | | 2 | - | 2 | | Gençlerbirliği | 8 Aralık 2012 Cumartesi 14:00 | 15. Hafta | |
| Gençlerbirliği | | 1 | - | 1 | | Beşiktaş | 15 Aralık 2012 Cumartesi 19:00 | 16. Hafta | |
| Bursaspor | | 0 | - | 0 | | Gençlerbirliği | 23 Aralık 2012 Pazar 16:00 | 17. Hafta | |
| Antalyaspor | | 3 | - | 5 | | Gençlerbirliği | 20 Ocak 2013 Pazar 13:30 | 18. Hafta | |
| Gençlerbirliği | | 1 | - | 0 | | Akhisar Bld. | 26 Ocak 2013 Cumartesi 16:00 | 19. Hafta | |
| Orduspor | | 2 | - | 1 | | Gençlerbirliği | 3 Şubat 2013 Pazar 13:30 | 20. Hafta | |
| Gençlerbirliği | | 0 | - | 2 | | Eskişehirspor | 9 Şubat 2013 Cumartesi 16:00 | 21. Hafta | |
| Gençlerbirliği | | 3 | - | 1 | | Mersin İ. Yurdu | 17 Şubat 2013 Pazar 13:30 | 22. Hafta | |
| Kayserispor | | 1 | - | 0 | | Gençlerbirliği | 24 Şubat 2013 Pazar 16:00 | 23. Hafta | |
| Gençlerbirliği | | 0 | - | 0 | | İstanbul BBSK | 1 Mart 2013 Cuma 19:00 | 24. Hafta | |
| Galatasaray | | 0 | - | 1 | | Gençlerbirliği | 8 Mart 2013 Cuma 20:00 | 25. Hafta | |
| Gençlerbirliği | | 2 | - | 1 | | Karabükspor | 16 Mart 2013 Cumartesi 16:00 | 26. Hafta | |
| Elazığspor | | 1 | - | 1 | | Gençlerbirliği | 31 Mart 2013 Pazar 19:00 | 27. Hafta | |
| Gençlerbirliği | | 2 | - | 2 | | Gaziantepspor | 7 Nisan 2013 Pazar 13:30 | 28. Hafta | |
| Sivasspor | | 1 | - | 1 | | Gençlerbirliği | 12 Nisan 2013 Cuma 20:00 | 29. Hafta | |
| Gençlerbirliği | | 2 | - | 0 | | Fenerbahçe | 21 Nisan 2013 Pazar 20:00 | 30. Hafta | |
| Trabzonspor | | 2 | - | 0 | | Gençlerbirliği | 27 Nisan 2013 Cumartesi 20:00 | 31. Hafta | |
| Gençlerbirliği | | 0 | - | 0 | | Kasımpaşa | 3 Mayıs 2013 Cuma 19:00 | 32. Hafta | |
| Beşiktaş | | 3 | - | 0 | | Gençlerbirliği | 11 Mayıs 2013 Cumartesi 20:00 | 33. Hafta | |
| Gençlerbirliği | | 2 | - | 2 | | Bursaspor | 19 Mayıs 2013 Pazar 16:00 | 34. Hafta | |